早於八十年代，在南丫島已有一位神父開始在自己的農地上以有機方式種植蔬菜，並賣給教友和市民。直到1988年，本港才有第一個有機農場─綠田園。踏入九十年代，香港越來越多人對有機耕作有興趣，陸續有不少有心人建立有機農場或從常規耕作轉為有機耕作，期間，共成立了12個有機農場。在1999年，在嘉道理農場暨植物園提供職員的協助下，一群熱心人士成立了「香港有機農業協會」。

隨著九十年代人們對有機蔬菜的需求和環境保護的關注，再加上香港都市化、經濟轉型及國內平價蔬菜的競爭，本港的漁農自然護理署在2000年開始積極參與協助發展有機農業，並於2000年12月推出有機耕作轉型計劃，制訂了「有機作物生產守則」，並向有意轉為有機耕作的傳統農友提供技術支援服務，以鼓勵傳統農友由以常規方式轉為以有機方式種植。